Bom, eu nunca fui um grande fã de flash, acho que o flash é para ser usado apenas em detalhes do site ou em funções especificas que realmente se faz necessário o seu uso, navegando por ai e acabei encontrando o blog inteligenciaonline.wordpress.com, com um artigo "Site em Flash ou HTML" que fazia uma comparação entre sites em flash e html.

Veja o artigo Site em Flash ou HTML clicando aqui.

PS. Caso o site esteja OFF, a cópia do artigo está em anexo nesse artigo.